综合来叙。
最初的时候，古中国云南地区的泰族因为遭到成吉思汗的进攻而迁徙到真腊王国，并被当时日益鼎盛的吴哥王朝收留为其中一个部落。收编之后，泰族还曾作为前锋跟随国王阇耶跋摩七世一起攻打过被李朝越南占领的地区占婆。但阇耶跋摩七世死后，吴哥王朝也日趋衰落，泰族就趁机背叛了曾经收留庇护过自己的吴哥王朝，并于1238年创建了素可泰Sukhothai王朝，且连年攻打吴哥，终于在1432年成功入侵，并对吴哥城大肆破坏，逼得当时的国王索里约波王不得不弃掉首都吴哥，于1434年迁都到百囊奔（现在的金边）。被废弃的不仅仅是通常意义上的吴哥窟，还包括吴哥王朝在该地区所修建的全部城池（即我们今天所说的吴哥遗迹群）。
而吴哥军队被打败的原因也有很多。其中包括：统治阶级生活奢华糜烂，而底层劳动人民的生活则困苦难安；长年大肆兴建寺庙等大型建筑，且精雕细琢劳民伤财；医疗，耕种等皆不发达，仅靠天所赐（以上在《真腊风土记》中皆有叙，该书记于
年间）；吴哥王朝最令人尊敬的阇耶跋摩七世去世后，国势衰微，民心不聚，开始陆续反抗和背叛统治阶级，更使外敌趁机入侵；更有说自阇耶跋摩七世时国教由印度教改佛教，佛教讲究宽容平和、无欲无争，因此军队和百姓都受到佛法教化而放弃了抵抗；最夸张的传说当属因改信佛教而使吴哥王朝失去了原印度教保护神毗湿奴的庇护。
另外据科学家推测，还可能是受到了气候的影响——其时正是14世纪小冰川期，虽无当地的确切记载，但根据全球气候情况可推测该地区也有可能遭受到了酷暑干旱等极炎天气或洞里萨湖的洪水侵袭，导致整个吴哥王朝上下都不得不放弃了这片土地整体迁徙。
双方皆弃城于此百年后，有高棉人陆续回来修葺旧都，想在此重新安居，被暹罗人发现后双方再次展开大战，不过这次是高棉人赢了，从此该地区被称为暹粒，暹就是暹罗，粒就是打败，所以暹粒就是“打败暹罗人的地方”。
但是古高棉人打胜之后也没有留在这里继续发展，而是也回到了金边。可能是因为旧都实在损毁得太过严重无法修复，可能是担心边境地区容易引发战争，还可能是担心洞里萨湖的洪水年年淹没这片土地不便耕耘居住，总之吴哥城就这样再次被荒弃在丛林中，并且随着时间的推移慢慢成为一个传说。。。古代柬埔寨自然环境恶劣，丛林中猛兽频出，附近又没有高地可供瞻观远眺（唯一制高点是丛林中仅为67米高的巴肯山），当地人也很少深入丛林中，且与外界世界脱节，便有所知也无处宣讲，慢慢的吴哥窟就更成传说。虽然偶尔会有一些冒险家、朝圣者发现它的遗迹，但他们不是将其误认为是印度神庙，就是默默地写进私人笔记里而不了了之，也有人向朋友宣传了但是没人相信。直到法国博物学家亨利·穆奥在世界各地收集蝴蝶资料的时候，偶然来到中国并发现了《真腊风土记》，请人翻译后他便被书中所描述的这个国家深深吸引了，于是循着周达观所叙述的线路来到柬埔寨，请了几个当地人带他一起在森林里披荆斩棘，寻找这片在当地人口中也是传说的伟大遗迹。
1861年1月，穆奥终于如愿所偿，在丛林深处发现了吴哥窟，回国后便出版了一本《暹罗柬埔寨老挝诸王国旅行记》（其中对吴哥窟做了详细的描述，包括塔高、护城河长度、佛像尺度等，而且配有他画的插图）向世人狠狠夸赞了一番。不过还是有很多人不甚相信，所以穆奥就再次踏上东南亚的土地，准备二次寻访吴哥窟，希望能够带回更多的证据。
可惜这一次他在丛林中感染了疟疾，1861年11月10日，年仅35岁的穆奥便病逝在这片神秘的土地上，现在他的墓还留在老挝的神秘古都琅勃拉邦。
1866年，法国摄影家艾米尔·基瑟尔Emile Gsell拍摄并发表了吴哥窟的照片，终于使人们亲眼目睹了吴哥窟的雄伟风采。但穆奥是吴哥古迹湮没数百年后第一个向世人公开著书、详细介绍的人，所以学界普遍将他默认为是“重新发现”吴哥窟的第一人。
