值乎我就不回答了，这里回答吧。
DNA 信息量大， 物种的差异会直接反映在 DNA 序列上，因此，可以根据 DNA 上不同区域、 基因、 片段的进化特点来选择适合的靶基因进行检测，不同组织、发育时期的 DNA 序列影响不大。DNA 检测方法特异性好、 灵敏度高、 操作简便， 已成为物种鉴定的主要检测方法．
利用DNA鉴定物种，首先需要选定目标区域，这是鉴定物种的关键。不同物种适合的区域不同。前几年流行起来的DNA barcoding，目标是利用短的DNA序列鉴定技术实现对地球上现存的约1000万物种进行快速和准确的鉴定。但是生物种类太多，无法使用统一或唯一的片段进行鉴定，不同的生物选定的鉴定片段是不同的，或者需要组合多个片段的序列确定具体物种。比如动物多使用线粒体细胞色素 c 氧化酶亚基Ⅰ( cytochrome c oxidase subunitⅠ, coxⅠ或 coⅠ) 基因，这段序列在动物界各个分类水平上该序列都具有良好的识别能力，但对植物和微生物不适用，比如真菌多使用内转 录 间 隔 区 （ internal transcribed spacer regeion, ITS ）,但还需要配合其它 ＤＮＡ 条 形 码（ LSU、SSU、 ＣＯＩ等），才能提高真菌分类的精确性；植物则推荐基于 ITS2 + psbA-trnH 片段组合的DNA 条形码鉴定系统等等等等。候选序列很多，需要根据待鉴定的物种选择。
很多对应序列的引物都有文献报道，不用自己设计。
总之，多查文献。
