首先，不管这是不是废话，所有的海洋非哺乳类生物都没有肺(有了肺就直接被压扁了)不管是深海鱼还是浅海鱼，通过鳃将水中的溶解氧转入血液中，进而存储到它们的肌肉中，它们的肌肉组织含有比一般生物高得多的浓度的氧结合肌红蛋白，随着深度的增加，其氧气的利用率更高。
一方面，Yayanos发现，深海的环境下让生物的细胞膜进化得更软更滑更具有流动性。如果它们的细胞膜（主要成分磷脂）太‘僵化‘, 在深海高压和低温下磷脂将会僵硬，因此生物活性通道将会关闭。“正因为如此，深海动物和细菌往往用相对流动的血脂建立自己的细胞膜。与浅海层的生物相比, 深海生物用更多的不饱和脂肪酸来组建细胞. 当这样的深海机体到达浅海域将会, 细胞内的脂肪收到的压力变小,它们将有可能会开始从内部渗透出来，这也解释了为什么深海鱼不能到浅海生存。. 即使不会马上死掉也会导致它们神经上的损伤。
The Physics of . . . Deep-sea Animals
另一方面，则是由于机体内容材质有关，比如水母体内95%的主要成分都是水，所以水母在高压下并不会收到压力的影响
Percentage of Water in Jelly-Fish : Abstract : Nature
另一方面，深海鱼的生理器官发生了改变，比如鲨鱼没有浅海鱼所拥有的鱼鳔。
更深层的研究表明： 深海鱼体内的氧化三甲胺(TMAO)加固了蛋白质，以抵抗随着海深的增加的压力，并且随着深度的增加，其体内TMAO含量也在增加。
http://apps.webofknowledge.com/full_record.do?product=UA&search_mode=GeneralSearch&qid=4&SID=V24j3x9kfZ3s7ywE4hR&page=1&doc=1
换句话说就是因为深海生物由于存在TMAO，它们能更加适应深海的压力。
最后，关于更多细节及机制问题，如果想了解，可以再更新
