这个很难说清楚。
我不是做这方面研究的，只能简单说说。
三省六部实际上是
中书
门下
尚书
然后尚书下辖六个部门。
如果按照现代政治学体系。
六部可能是事务官，三省是政务官。
实际上这种从上而下的公文路径，中书决策、门下审核批准或者封驳、尚书执行，然后分发六部的时间很短，
大部分时间，中书门下实际上是一起的，他们逐渐形成一种中书门下共同会议决定办事，以防止来回封驳。
从而实际上来说，中书门下大多数情况下，在玄宗之后，以一个机关出现即政事堂，然后尚书沦为执行机关，六部是尚书的下属机构，尚书省由于首长尚书令，李世民曾担任过，所以只有左右仆射。
唐代皇帝大多数情况下，直达事物机关，不经过中央决策机关写的命令，不能叫做敕，“不经中书门下，何言为敕！”。
理清楚到这里，可以说。实际上而言。
中书门下
与
尚书+其下属的六部
实际上很难对应现代中国的权力结构和权力机关。
实际上而言。
古代（至少宋代之前）立法、行政几乎浑然一体。
所以严格来说，
中书和门下其实扮演的是立法机关，以及，最高行政机关的决策部门。（门下再其独立时期与中华民国的监察部门有点相似）
尚书及其六部，其实是国务院的（非决策性）执行机关以及各部。
至于六部对应现在什么部门。
纷繁复杂，一本书也说不完，因为古代的部门分类结构与现代完全不同。
可以参考清末庚子之后的政府部门改革。
