什么是高通量组学?什么是高通量组学数据?

什么是高通量组学?什么是高通量组学数据?

高通量的意思是某一样本的数据深度大(维度高)。现在所指的高通量组学数据多是基因组、转录组数据(蛋白质的X衍射和NMR算不算高通量我也不确定,希望清楚的伙伴答一下),因此一般是指NGS(next generation sequencing)数据,主要包含二代测序和三代测序数据,其特点相比于一代测序就是深度大大提升(测序分子量大),而它们的测序对象可以针对DNA、cDNA(逆转录获取)、RNA。

所以高通量组学可以认为是提升了样本的可靠性(测序错误被较大程度避免),而且是可以获取对样本更深入理解的数据—蕴含的信息量更大,你可以用它做基因组组装、mapping、snv/snp/cnv搜寻、表达矩阵、调控网络分析等等。